Copa Libertadores 1972:

En la Copa Libertadores de 1972, sin duda alguna la Copa más recordada por los hinchas cremas, Universitario con un equipo suplente llegó hasta la final, pues los principales jugadores se encontraban con la selección en la denominada 'Gira de los tres continentes'.

Universitario formó parte del grupo 4 junto con Alianza Lima, Universidad de Chile y Unión San Felipe. El primer partido de Universitario fue el superclásico peruano, el cual ganó 2-1. 

Los dos siguientes partidos fueron en Santiago contra la Universidad de
Chile donde perdió 1-0 y contra Unión San Felipe con el que empató 0-0. Universitario regresó al Perú para jugar contra Alianza Lima donde consiguió un empate 2-2. 

En los dos últimos partidos la U recibió en Lima a Unión San Felipe y a la Universidad de Chile donde consiguió dos victorias por 3-1 y 2-1 respectivamente, obteniendo 8 puntos, lo cual le permitió avanzar a la siguiente ronda como primero del grupo.

En las semifinales la U fue agrupado con Peñarol y Nacional de Uruguay. En el primer partido la U perdió con Peñarol 3-2 en Lima, pero luego se recuperó ganando al Nacional 3-0. 

Universitario viajó a Uruguay en donde consiguió dos empates 3-3 contra Nacional y 1-1 contra Peñarol. La U, había acumulado 4 puntos y solo quedaba un partido entre Peñarol y Nacional, que tenían 4 y 2 puntos respectivamente. Los tres equipos tenían oportunidad de pasar a la final. 

Peñarol solamente necesitaba un empate, mientras que Nacional necesitaba una victoria por 5 goles de diferencia. El partido terminó 3-0 a favor de Nacional permitiendo a Universitario pasar a la final ya que tenía una mejor diferencia de goles.

La final la jugó contra Independiente de Argentina, el partido de ida se realizó en Lima donde empataron 0-0. El partido de vuelta terminó 2-1 a favor de los argentinos. 

Aunque Universitario no se quedó con el título, habían conseguido ser el primer club peruano en alcanzar la final de la Copa Libertadores de América.

Dos años después en 1974 la "U" celebra sus Bodas de Oro, crea la Escuela de Fútbol "Lolo Fernández" (28 de septiembre) y cierra el año campeonando en el torneo local. 

En la década de los 80, después de ocho años Universitario consiguió el título nacional. Lo hizo tras ganar sus tres compromisos en la liguilla final, consiguiendo 6 puntos. 

El triunfo que le dio el título fue ante Deportivo Municipal, al que venció 1-0 con anotación de Hugo Gastulo. Percy Rojas tuvo una destacada participación y fue fichado por el Independiente de Avellaneda de Argentina.

El 26 de febrero de 1983, se inaugura el Complejo Deportivo Campo
Mar - U. En 1985, debuta en el club José Luis Carranza y el título fue nuevamente para la "U". 

Universitario de Deportes volvió a lo grande en 1987, como primer paso para este nuevo lauro obtuvo el título del Torneo Regional, con lo que
quedó a la espera del ganador de la liguilla para disputar el título nacional. Luego vino el Descentralizado, que fue para Alianza Lima. 

El clásico definitorio fue para los merengues por 1-0, con anotación de Fidel Suárez.

En los años 1990, Universitario consigue cinco títulos nacionales. En 1990 campeonó Universitario de Deportes, que previamente había ganado el Torneo Regional y debía medirse por el título nacional de la temporada con Sport Boys del Callao, vencedor de la liguilla. 

El triunfo fue para Universitario, que se impuso 4-2, con anotaciones de
Roberto Martínez (2), Cedres y Araujo, mientras que por el Sport Boys descontaron Requena (autogol) y París. 

En 1992, fue campeón la "U" en un torneo en donde se volvió al sistema de los torneos descentralizados de dos ruedas, dejándose de lado los
certámenes regionales. Universitario de Deportes se llevó el título faltando una fecha para el final del campeonato, tras ganarle 4-1 al Deportivo San Agustín, con goles de Ronald Baroni (2), César Charún y José Luis Carranza. Para los rivales anotó Pavel Villavicencio.

Bajo la dirección de Sergio Markarián, la "U" revalidó su título en 1993, logrando un nuevo bicampeonato para la institución. Lo hizo luego de vencer 3-0 a San Agustín, con Juan Carlos Zubczuk en el arco y anotaciones de Jorge Amado Nunes (2) y Roberto Martínez. Es el cuarto bicampeonato de la "U".